Degradacja środowiska wyraźnie wpływa też na liczebność i zróżnicowanie gatunkowe organizmów. Najczęściej prowadzi do zmniejszenia różnorodności biologicznej, a jedynie ona daje gatunkom i ich zespołom możliwość przetrwania w zmieniających się warunŹkach. W wyniku rabunkowych i nieprzemyślanych działań ginie wiele naturalnych siedlisk, a wraz z nimi wiele gatunków o specjalnych wymaganiach. Pozostają jedynie orŹganizmy mało wymagające, oportunistyczne lub synantropijne, jak na przykład wróble i szczury. Nawet z egoistycznego i antropocentrycznego punktu widzenia człowieka niszŹczenie różnorodności biologicznej jest niekorzystne, ponieważ pozbawiamy się możliwoŹści uzyskania nowych surowców i źródeł żywności, barwników czy lekarstw. Należy także pamiętać, że z powodu olbrzymiej złożoności układów przyrodniczych ingerencja człoŹwieka powoduje nieprzewidywalne skutki i może się skończyć katastrofą (tzw. efekt domiŹna). Przykładowo wycięcie lasu pociąga za sobą także zmianę mikroklimatu, zmniejszenie retencji wód, spadek poziomu wód gruntowych, zwiększenie niebezpieczeństwa powodzi, silniejszą erozję gleby, wzrost poziomu hałasu i wiele innych skutków.